《办法》规定，独立学院对学习期满且成绩合格的学生，颁发毕业证书，并以独立学院名称具印，对符合条件的学生颁发独立学院的学士学位证书。此前，独立学院学生的毕业证都是由独立学院颁发，但学位证由举办独立学院的“母体学校”授予。对此，教育部有关负责人表示，现有在校学生实行“老人老办法”，仍可获得“母体学校”的学位，2008年入校的学生按新办法执行。

　　该《办法》对“母体学校”还进一步明确，要按照合作办学协议和国家有关规定，对独立学院的教学和管理工作予以指导，完善独立学院教学水平的监测和评估体系。独立学院按不低于1：200的师生比配备辅导员，每个班级配备1名班主任。并规定，符合条件的普通高等学校一般只可以参与举办1所独立学院。独立学院的名称前冠以参与举办的普通高等学校的名称，不得使用普通高等学校内设院系和学科的名称。参与举办独立学院的社会组织，应当具有法人资格，注册资金不低于5000万元，总资产不少于3亿元，净资产不少于1.2亿元，资产负债率低于60%；参与举办独立学院的个人，应当具有政治权利和完全民事行为能力，个人总资产不低于3亿元，其中货币资金不少于1.2亿元。

　　此外，该《办法》还明确提出，独立学院如有发布未经备案的招生简章或广告、违反国家招生计划擅自招收学生等情形之一的，将由省级教育行政部门责令限期改正，并视情节轻重，给予警告、罚款、减少招生计划或者暂停招生的处罚。